Una condizione di carenza di ormone tiroideo presente dalla nascita. All'incirca 1 neonato su 4000 presenta una grave carenza di funzionalità tiroidea, mentre anche di più ne hanno quantità deboli o parziali.Se non viene trattato per parecchi mesi dopo la nascita, l'ipotiroidismo congenito può sfociare nella disabilità intellettiva come ad es. un ritardo mentale permanente e una crescita anormale.Negli Stati Uniti e in molti altri paesi, tutti i neonati vengono sottoposti ad un test per ipotiroidismo congenito. Se il trattamento inizia nei primi mesi dopo la nascita, i neonati di norma si sviluppano normalmente.