Cobalion es un cuadrúpedo de cabra como Pokémon, aqua-azul en coloración. Sus cuernos amarillos parecen algo thunderbolts. Su hocico es un poco azul claro de su piel. En su largo cuello y traseros patas son pequeñas manchas grises. Tiene un mechón blanco de piel en el cuello. Tiene shoulderblades amarillo que se asemejan a aletas en la cabeza un Carvanha, Magikarp o de Gyarados. Sus patas traseras también albergan manchas grises. Su cola, también del mismo color que su hocico, parecido a aleta cabeza de Gyarados. Las piernas de Cobalion tienen bandas negras con semi-large pies negros y piel azul claro y oscuro.