Mewtwo es uno de los primero Pokémon creado por la ciencia. Los científicos que lo creó soñaba con crear Pokémon más fuerte del mundo. Es considerado único, porque sólo uno fue creado genéticamente. Sin embargo, esto todavía no ha confirmado plenamente.

Mewtwo es una criatura con una postura de humanoide, pero tiene unos felinos. Cuerpo de Mewtwo es púrpura grisáceo con un envés púrpura y un largo, púrpura cola. Mewtwo tiene tres dígitos circulares en cada apéndice. Tiene ojos púrpuras (a veces azules al atacar) y dos orejas cortas.Características más notables de

uno de Mewtwo es el tubo que se extiende desde la parte posterior de su cráneo a su columna vertebral. Es más probable una médula espinal secundario o un sistema de nervios, lo que permite una mayor cantidad de sangre y la transmisión sensorial al cerebro, elevando sus poderes psíquicos.