Una enfermedad en la cual el sistema inmunitario, naturalmente diseñado para proteger el cuerpo contra invasores extraños tales como virus y bacterias, en lugar de ello se vuelve contra y causa daño a los tejidos sanos del cuerpo. El sistema inmune es una compleja organización dentro del cuerpo que se diseña normalmente a los invasores "seek and destroy" del cuerpo, incluyendo a agentes infecciosos. Pacientes con autoinmune enfermedades tienen con frecuencia inusuales anticuerpos circulantes en la sangre que atacan los propios tejidos del cuerpo.

Enfermedades autoinmunes ejemplos de lupus eritematoso sistémico, síndrome de Sjögren, tiroiditis de Hashimoto, artritis reumatoide, diabetes juvenil (tipo 1), polimiositis, esclerodermia, Addison enfermedad, vitíligo, anemia perniciosa, glomerulonefritis y fibrosis pulmonar.

Las enfermedades autoinmunes son más frecuentes en mujeres que en hombres. Se considera que el estrógeno de las hembras puede influir en el sistema inmunológico que predisponen a algunas mujeres a las enfermedades autoinmunes. Por otra parte, la presencia de una autoinmune enfermedad aumenta la probabilidad de desarrollar otra enfermedad autoinmune simultánea.