1) Campo que utiliza las secuencias de proteínas, de expresión y estructura para determinar cómo se relacionan las proteínas, interactuar y funcionar en un organismo; incluye la caracterización y catalogación de las proteínas y las bibliotecas de la proteína, comparando las variaciones en los niveles de expresión de la proteína bajo diferentes condiciones, estudiar las interacciones proteína y roles funcionales; técnicas se realizan de manera automatizada a gran escala; también puede involucrar análisis bioinformático y almacenamiento de datos.

2) El estudio sistemático del complemento completo de proteínas (proteoma) de los organismos.

3) Una rama de la biotecnología afectada con la aplicación de las técnicas de biología molecular, bioquímica y genética para el análisis de la estructura, función y las interacciones de las proteínas producidas por los genes de una celda particular, tejido u organismo, organizar la información en bases de datos y con las aplicaciones de los datos (como medicina o biología).

4) El estudio de los genes y sus proteínas resultantes el papel había desempeñado por las proteínas procesos bioquímicos del cuerpo.