La "hipótesis de higiene," a veces se denomina la "hipótesis viejos amigos", es que los seres humanos han evolucionado con ciertas bacterias intestinales y gusanos cuya presencia puede "entrenar" al sistema inmune no exagerada contra microorganismos comensales inofensivos. Personas se han vuelto más prósperas y llevan estilos de vida "saludables", estos organismos se han perdido desde los intestinos y el sistema inmunológico está perdiendo su equilibrio natural. Esto predice un aumento significativo de enfermedades inmunes, alérgicas y autoinmunes, que de hecho ha sido observado en el mundo desarrollado en las últimas décadas.