Genómica es el estudio de la organización, estructura y función de la dotación total de genes y otro ADN dentro de las celdas de un organismo. Este término usualmente se refiere al contenido de ADN nuclear haploide (que poseen un único conjunto de cromosomas sin emparejar) en las células eucariotas. Genómica puede diferenciarse de genética (a lo largo de un continuo), con el ex preocupada acerca de la función y la interacción de varios genes, ADN noncoding (tales como intrones (segmentos de ADN que no codifica parte de la proteína del gen y son empalmados de ARN mensajero en el procesamiento) y ADN intergénicas (secuencias de ADN situadas entre grupos de genes)) y arquitectura de genoma. Este último se refiere principalmente a un solo gen y sus productos.

Siguiendo este esquema, paleogenomics se centra en la recuperación y comprensión de la información genómica de especies extintas durante mucho tiempo. Estrictamente definido, paleogenomic investigación debe incluir restos fósiles originales como su fuente principal de datos. Por lo tanto, el término "paleogenomics" no debe aplicarse a los estudios de genómica comparativos que infieren patrones ancestrales o Estados de carácter de especies vivas solo. Las investigaciones en los genomas de recientemente extinto organismos son más bien llamados "archeogenomics" o "estudios de ADN antiguos." Porque el campo de la genómica se centra en los organismos vivos, se ocupa sólo una fracción de la genómica novedad que ha evolucionado. Investigación de ideas de paleogenomic, por tanto, son indispensables para una comprensión profunda de la naturaleza y evolución del genoma eucariota.