Ang tagapamagitang reaksyon ay ang molekular na entidad na may pang habam-buhay na kapuna-punang mas mahaba sa malekular na panginginig (naaayon sa isang lokal na mga potensyal na enerhiya kaunti ang lalim mas malaki sa RT) na nabuo mula sa mga reaktante na mas gumaganti upang ibigay ang mga produkto ng isang reaksyon ng kemikal.