Los hongos son organismos eucariotas sabe que habitan en casi todos los nichos ecológicos de la tierra y tienen la capacidad de utilizar diferentes sustratos sólidos como consecuencia de la diversidad de su evolución biológica y bioquímica. Algunos de los sustratos sólidos utilizados por hongos son muertos y descomposición de material, incluyendo estiércol de herbívoro (hongos saprófitos y COPROFILA), viven plantas (hongos micorrizas endofítico y parásitos), líquenes (hongos lichenicolous y endolichenic) e insectos (hongos entomopatógenos).

a característica de muchos de estos hongos, especialmente aquellos que exhiben crecimiento filamentoso y tienen una morfología relativamente compleja, es su capacidad para producir metabolitos secundarios. Fuentes de hongos Soilborne, parásito y saprófito están relativamente bien investigadas con respecto a sus metabolitos secundarios, y actualmente hay un intenso interés en metabolitos secundarios de hongos simbióticos que viven en asociación con plantas terrestres, insectos, líquenes y organismos marinos. En contraste con los metabolitos primarios, como proteínas, ADN, RNA, polisacáridos etc., que ocurren universalmente, metabolitos secundarios son compuestos orgánicos de molécula pequeña que se encuentra restringido a una determinada especie, género o familia. Metabolitos de por lo tanto, la presencia o ausencia de cierto secundaria ha sido utilizado con éxito en la clasificación (chemotaxonomy) de géneros de gran ascomicetes (incluyendo Alternaria, Aspergillus, Fusarium, Hypoxylon Penicillium, Stachybotrys y Xylaria) y en unos pocos géneros de basidiomycetes.

Muchos metabolitos secundarios no están involucrados directamente en el crecimiento normal, el desarrollo o la reproducción del hongo en que ocurren, pero ellos pueden desempeñar un papel importante en las interacciones ecológicas con otros organismos. Por esta razón, muchos hongos metabolitos secundarios exposición útiles actividades biológicas y son de interés para las industrias farmacéutica, alimentaria y agroquímicos. Producción de metabolitos secundarios a menudo se produce después de micótica ha dejado como resultado de las limitaciones de nutrientes pero con una fuente de carbono excedente disponible, haciendo posible manipular su formación. Es intrigante que algunos hongos endofítico son capaces de producir metabolitos secundarios previamente conocidos de las plantas. Destacables ejemplos incluyen producción de dos medicamentos anticancerígenos clínicamente importantes, paclitaxel (Taxol ®) y camptothecin, Taxomyces andreanae y Nothapodytes foetida, respectivamente y un precursor sintético de un fármaco anticancerígeno, podophyllotoxin, por Phialocephala fortinii.